Tiền thân của Trung tâm Khí hậu APEC là Mạng lưới Khí hậu APEC (APCN) được thành lập bởi Nhóm Công tác về Công nghệ và Khoa học Công nghiệp APEC (ISTWG). Mạng lưới được thành lập với mục đích trao đổi thông tin khí hậu giữa các nền kinh tế APEC nhằm chống lại các thảm họa khí hậu và thời tiết. Nó đã được đề xuất trong cuộc họp ISTWG APEC lần thứ 16 năm 1999 bởi Cục Khí tượng và Thủy văn Hàn Quốc và mạng lưới đã có cuộc họp nhóm làm việc đầu tiên vào tháng 5 năm 2001.[1]

APCN được khởi xướng để chia sẻ thông tin khí hậu khu vực đáng tin cậy giữa các nền kinh tế. Nỗ lực đã được biện minh về lý do kinh tế. Bằng cách chia sẻ thông tin của các tổ chức khí tượng quốc gia, các tổ chức đã nhận được thông tin khí hậu chính xác hơn thông qua kỹ thuật tổng hợp nhiều mô hình, kết hợp phạm vi thông tin khí hậu đa dạng do các tổ chức đệ trình để tạo ra thông tin khí hậu chính xác hơn. Để tiếp tục phát triển kỹ thuật và giúp các nền kinh tế thành viên APEC tăng cường khả năng dự báo khí hậu của họ thông qua các nỗ lực xây dựng năng lực, nó được coi là cần thiết để tạo ra một tổ chức chính thức. Vì vậy thông qua các cuộc thảo luận được tổ chức tại Hội nghị Bộ trưởng Khoa học và Công nghệ APEC năm 2004, Hội nghị ISTWG năm 2004 và Hội nghị các quan chức cấp cao năm 2005, việc thành lập Trung tâm Khí hậu đã được APEC phê duyệt.[2][3]